民國期間稱蒲岐鎮(zhèn)，民國后期為蒲岐鄉(xiāng)。
1949年12月以蒲岐鄉(xiāng)地置蒲岐鎮(zhèn)；1956年2月原蒲岐鎮(zhèn)、臨海、南岳、南聯(lián)三鄉(xiāng)及天成鄉(xiāng)的埠頭和萬橋2村合并設(shè)立蒲岐鄉(xiāng)；1958年公社化時(shí)，原并入的鄉(xiāng)、村析出，原蒲岐鎮(zhèn)鎮(zhèn)成立蒲岐管理區(qū)，屬蒲岐公社；1961年管理區(qū)撤銷，改稱蒲岐公社；1984年3月，政社分設(shè)，改稱蒲岐鄉(xiāng)，屬虹橋區(qū)；1985年4月改為建制鎮(zhèn)；2011年5月，蒲岐鎮(zhèn)建制撤銷，其行政區(qū)域并入虹橋鎮(zhèn)；2015年12月，虹橋鎮(zhèn)調(diào)整管轄范圍，增設(shè)蒲岐鎮(zhèn)。