解放初為卅六都鄉(xiāng)十二村，1956年為恩深農(nóng)業(yè)社，1958年為卅六都管理區(qū)恩深生產(chǎn)隊，1961年改妙里圳公社恩深大隊，1983年底改妙里圳鄉(xiāng)恩深村民委員會。
解放初為卅六都鄉(xiāng)十七村，1956年為妙里圳鄉(xiāng)前進農(nóng)業(yè)社，1958年為妙里圳管理區(qū)前進生產(chǎn)隊，1961年改妙里圳公社樟柏樹底大隊，1983年底改妙里圳鄉(xiāng)樟柏樹底村民委員會。
1986年6月屬新塘邊鎮(zhèn)。
2007年，經(jīng)江山市委研究決定，將恩深、樟柏樹底合并為恩深村。
新村辦公場所設(shè)在原恩深村辦公樓。