清代部分村落已建村。
1737年始?xì)w屬麗江府吉尾、山后約，清晚期屬麗江縣山后里。
1912年蘭坪設(shè)治之初，劃歸西新化里。
1921年屬第五區(qū)西新化里，屬梭羅寨村。
1933年推行區(qū)、鄉(xiāng)鎮(zhèn)自治，設(shè)第三區(qū)文明鄉(xiāng)，治所設(shè)今恩棋村委會知其位（今改稱恩棋村），為閭、鄰建制。
1938年改為保甲制。
1940年全面推行鄉(xiāng)鎮(zhèn)保甲建制，將梭羅寨、知其位2個(gè)村編為石寶鄉(xiāng)第六保，直至解放初。
1953年劃區(qū)鄉(xiāng)政權(quán)時(shí)，以石寶鄉(xiāng)第六保為區(qū)域成立第四區(qū)恩棋鄉(xiāng)。
1958年下半年公社化時(shí)期屬營盤人民公社恩棋管理區(qū)，基本以村為單元組建生產(chǎn)隊(duì)。
1962年4月歸屬第四區(qū)營盤片，為恩棋公社，1967年11月劃編為營盤區(qū)革命委員會恩棋人民公社。
1969年1月更名為營盤公社革命委員會恩棋大隊(duì)。
1984年2月設(shè)區(qū)建鄉(xiāng)，成立營盤區(qū)恩棋鄉(xiāng)人民政府。
1987年12月撤銷區(qū)的建制，實(shí)行鄉(xiāng)鎮(zhèn)制，設(shè)立營盤鎮(zhèn)恩棋辦事處，原生產(chǎn)隊(duì)改稱生產(chǎn)合作社。
2000年12月“村改委”改稱恩棋村民委員會，自得名后沿用至今。