1949年前為龍馬鄉(xiāng)3、5保，1949年實(shí)為龍馬鄉(xiāng)農(nóng)會(huì)3、5分會(huì)，1950年時(shí)屬石灰村上頭村，1958年公社會(huì)公時(shí)為龍馬公社化時(shí)為龍馬公社2管區(qū)，1959年新津大邑合縣后劃文井公社9管區(qū)，1962年分縣后為龍馬公社3大隊(duì)，1980年未寶墩大隊(duì)，后為寶墩村，2005年5月13日，經(jīng)新津縣人民政府同意撤銷寶墩村、大林村，組建寶墩村，沿用至今。
2020年村社區(qū)調(diào)整，同意將雙石村與寶墩村合并設(shè)立寶墩村。
寶墩村村委會(huì)辦公地點(diǎn)為原寶墩村黨群服務(wù)中心；新津縣人民政府批準(zhǔn)，批復(fù)號(hào)為新津府函【2020】93號(hào)。