子云村1949年前屬于龍溪鄉(xiāng)三保和三元鄉(xiāng)七保，1950年后屬于龍溪鄉(xiāng)前進村、三元鄉(xiāng)子云村和金龍村的部分。
公組化時期的1962年將原子云村和金龍村的部分區(qū)域調(diào)整為第五大隊。
1981年改為子云大隊，1984年定名為子云村。
2004年9月，清河鎮(zhèn)域友愛鎮(zhèn)合并為友愛鎮(zhèn)，2005年6月的撤組并村改革中，原金龍村、子云村合并為子云村。
2020年5月，村組優(yōu)化調(diào)整，原子云村，原白鴿村合并為子云村。
2020年村社區(qū)調(diào)整，同意將子云村和白鴿村合并，設(shè)立子云村村民委員會。
郫府函〔2020〕90號。