1951年，隸屬于元壩鄉(xiāng)。
1958年，隸屬于元壩公社，更名為1大隊（人民公社化運動）。
1980年，隸屬于火峰公社，更名為琴臺寺大隊（一普避重名）。
1984年，隸屬于火峰鄉(xiāng)，更名為琴臺寺村。
1992年，隸屬于南隆鎮(zhèn)（合鄉(xiāng)并鎮(zhèn)）。
1994年，隸屬于河東鎮(zhèn)。
1997年，隸屬于火峰鄉(xiāng)。
2020年，村級建制調整，撤銷琴臺寺村、二郎廟村，設立琴臺寺村。
2020年，社區(qū)建制調整，撤銷琴臺寺村，設立琴臺寺社區(qū)（南府函〔2020〕158號）至今。