1951年，屬巴中縣興隆鄉(xiāng)管轄。
1958年，設立鳳凰廟管理區(qū)，又稱第一管區(qū)。
1962年，更名為鳳凰廟生產(chǎn)大隊，簡稱鳳凰廟大隊，又稱一大隊。
1969年，更名為鳳凰廟大隊革命委員會。
1981年，復名鳳凰廟生產(chǎn)大隊。
1984年，全國實行政社分設，撤銷鳳凰廟生產(chǎn)大隊，設立鳳凰廟村村民委員會，簡稱鳳凰廟村村委會。
1993年，屬巴中市（縣級）興隆場鄉(xiāng)管轄。
2000年，屬巴中市巴州區(qū)興隆場鄉(xiāng)管轄。
2013年，屬巴中市恩陽區(qū)興隆場鄉(xiāng)管轄。
2016年，屬巴中市恩陽區(qū)興隆鎮(zhèn)管轄。
2020年，村級建制調(diào)整，將龍頂村5組、金鴨村1組、鳳凰廟村2、3、4、5組合并，設鳳凰廟村。