解放后，設(shè)立水磨溝行政村。
1960年5月，巴塘縣全面開展人民公社化運(yùn)動(dòng)；同年9月，設(shè)立水磨溝生產(chǎn)大隊(duì)管理委員會(huì)，簡稱水磨溝生產(chǎn)大隊(duì)、水磨溝大隊(duì)。
1966年5月，我國“文化大革命”開始，1972年5月，更名為水磨溝生產(chǎn)大隊(duì)革命委員會(huì)。
從1978年11月黨的十一屆三中全會(huì)開始，對(duì)我國“文化大革命”的錯(cuò)誤進(jìn)行撥亂反正；1981年6月，復(fù)名水磨溝生產(chǎn)大隊(duì)管理委員會(huì)。
1983年10月，我國實(shí)行政社分設(shè)；1984年7月，撤銷水磨溝生產(chǎn)大隊(duì)管理委員會(huì)，選舉產(chǎn)生水磨溝村民委員會(huì)，簡稱水磨溝村委會(huì)。