春秋時(shí)期，晉國翟氏定居于此，故名瞿村。
1942年汾河決口，南瞿被淹，西頭村民大部分遷入北瞿，東頭村民遷于北二里高地新建，故名南瞿村。
解放初屬陽曲縣。
1958年8月，中共中央作出《關(guān)于在農(nóng)村建立人民公社問題的決議》，我國全面開展人民公社化運(yùn)動(dòng)，實(shí)行政社合一、撤鄉(xiāng)建社，農(nóng)業(yè)生產(chǎn)合作社改稱生產(chǎn)大隊(duì)。
1970年歸北郊區(qū)。
1983年10月，中共中央、國務(wù)院聯(lián)合發(fā)出《關(guān)于實(shí)行政社分開建立鄉(xiāng)政府的通知》，要求實(shí)行政社分開，恢復(fù)鄉(xiāng)，建立鄉(xiāng)人民政府。
同時(shí)，生產(chǎn)大隊(duì)更名為村，撤銷生產(chǎn)大隊(duì)管理委員會(huì)，選舉產(chǎn)生村民委員會(huì)。
1998年劃歸尖草坪區(qū)，屬向陽鎮(zhèn)管轄。