1958年8月，第三次區(qū)劃調整，撤銷杜寨鄉(xiāng)，設立楊陵鄉(xiāng)。
元樹、崔西溝、崔東溝、馬家底4個自然村組建元樹生產大隊，隸屬于楊陵鄉(xiāng)；10月，隸屬于楊陵（紅旗）人民公社；12月，武功縣并入興平縣，元樹生產大隊隸屬于興平縣楊陵人民公社。
1959年3月，興平縣楊陵人民公社下設楊村等4個管理區(qū)，元樹生產大隊隸屬于楊村管理區(qū)。
1961年9月，第四次區(qū)劃調整，復設武功縣，武功縣撤銷楊村管理區(qū)，設立武功縣楊陵人民公社，元樹生產大隊隸屬于武功縣楊陵人民公社。
1982年2月，陜西省設立寶雞市楊陵區(qū)，元樹生產大隊隸屬于寶雞市楊陵區(qū)楊陵人民公社。
1983年10月，楊陵區(qū)劃歸咸陽市管轄，元樹生產大隊隸屬于咸陽市楊陵區(qū)楊陵人民公社。
1984年3月，國家行政區(qū)劃體制改革，人民公社稱謂改“鄉(xiāng)”，生產大隊稱謂改“村”。
楊陵區(qū)撤銷楊陵人民公社，設立楊村鄉(xiāng)，元樹生產大隊析為元樹、崔西溝、崔東溝、馬家底4個行政村，元樹村、崔西溝村隸屬于楊村鄉(xiāng)。
2011年6月，楊陵區(qū)撤銷楊村鄉(xiāng)，元樹村、崔西溝村隸屬于楊陵街道。
2015年3月，楊陵區(qū)鎮(zhèn)村行政區(qū)劃調整，元樹村、崔西溝村合并為元樹村，隸屬于楊陵街道。