清朝康熙年間屬崖屋店村，清同治年間屬北鄉(xiāng)清水保。
民國11年屬第四區(qū)，民國36年屬青曲鄉(xiāng)龔家保。
1948年稱龔家村。
1951年土改，稱龔家鄉(xiāng)。
1955年撤鄉(xiāng)建社，為和平農(nóng)業(yè)合作社，屬黌門區(qū)管轄。
1956年黌門區(qū)與大柳區(qū)合并為大堰區(qū)，和平農(nóng)業(yè)合作社屬大堰區(qū)管轄。
1958年人民公社化，為和平大隊(duì)，屬火箭人民公社管轄。
1961年撤社建區(qū)，和平大隊(duì)屬大堰區(qū)管轄。
1975年撤區(qū)并社，和平大隊(duì)屬青曲公社管轄。
1981年，更名為店子河大隊(duì)，屬青曲公社管轄。
1984年撤社并區(qū)，大隊(duì)改村，更名為店子河村，屬大堰區(qū)果園鄉(xiāng)管轄。
1987年撤區(qū)建鄉(xiāng)（鎮(zhèn)），店子河村屬青曲鎮(zhèn)管轄至今。