元朝屬順元路落邦札（扎）佐等處蠻夷長官司。
明初，屬扎佐長官司。
明末清初屬貴陽府新貴縣北下里。
康熙二十六年（1687年），屬貴筑縣北下里甲。
民國四年，屬東區(qū)七保。
民國二十一年，區(qū)以下廢保建制，置鄉(xiāng)（鎮(zhèn)），村境屬第三區(qū)泗溪鄉(xiāng)。
民國二十四年，廢鄉(xiāng)（鎮(zhèn)），置聯(lián)保，屬第三區(qū)泗溪聯(lián)保。
民國二十七年，屬第三區(qū)清讓聯(lián)保泗溪保。
民國三十一年，推行新縣制，撤銷區(qū)和聯(lián)保置鄉(xiāng)（鎮(zhèn)），屬清讓鄉(xiāng)。
1949年解放后，屬修文縣扎佐區(qū)清讓鄉(xiāng)。
1952年，屬修文縣第二區(qū)（扎佐）清讓鄉(xiāng)。
1958年，大辦人民公社，村境建雙月生產隊和泗溪生產隊，屬飛躍人民公社清讓管理區(qū)。
1959年，屬扎佐公社清讓管理區(qū)。
1961年，原管理區(qū)改為人民公社，生產隊改為生產大隊，生產小隊改為生產隊，隸屬扎佐區(qū)清讓公社。
1984年，政社分設，原公社改為鄉(xiāng)，生產大隊改為村民選舉產生的群眾性自治組織。
，生產隊改為村民小組，隸屬扎佐區(qū)清讓鄉(xiāng)。
1992年撤區(qū)并鄉(xiāng)后，劃屬新建的扎佐鎮(zhèn)。
2013年修文縣村級區(qū)劃調整，將泗溪村和雙月村合并建立清溪村。
2020年5月撤銷扎佐鎮(zhèn)（含珍珠河社區(qū)服務中心），設立扎佐街道和景陽街道。
清溪村歸屬景陽街道管轄。