解放前，南門(mén)村隸屬遵義縣洗馬鎮(zhèn)石字保。
解放初期未建南門(mén)村，隸屬遵義縣豐樂(lè)鎮(zhèn)顏村鄉(xiāng)蘭家村，1950年9月至1952年7月，蘭家村劃歸遵義市管轄，南門(mén)隸屬蘭家村。
1952年7月建遵義市南關(guān)鄉(xiāng)政府，至1955年8月，南門(mén)隸屬蘭家村。
1955年8月至1958年8月建立幸福莊高級(jí)社，南門(mén)隸屬幸福人民公社管理委員會(huì)，蘭家村改為蘭村大隊(duì)，南門(mén)歸蘭村大隊(duì)管轄。
1959年3月至1961年9月，幸福莊公社與豐樂(lè)公社合并為“遵義市豐樂(lè)公社”，公社下設(shè)南關(guān)管理區(qū)時(shí)南門(mén)師專(zhuān)農(nóng)場(chǎng)實(shí)行“以廠(chǎng)帶社”，1960年回歸原建置，南門(mén)仍屬南關(guān)管理區(qū)蘭村大隊(duì)。
1961年8月，政區(qū)調(diào)整，南門(mén)大隊(duì)建立。
至1984年4月，人民公社管理委員會(huì)改稱(chēng)鄉(xiāng)人民政府，南門(mén)大隊(duì)改稱(chēng)南關(guān)鄉(xiāng)南門(mén)村。
1993年4月，鄉(xiāng)改稱(chēng)鎮(zhèn)，南門(mén)村改稱(chēng)南關(guān)鎮(zhèn)南門(mén)村委會(huì)。
2016年6月，撤南關(guān)鎮(zhèn)設(shè)南關(guān)街道辦事處。