相傳明成化年間（1465-1487），此地在汪洋大海中漸成小島嶼。
明末時烽煙四起，民不聊生，不少難民先后逃到此處定居。
清康熙縣志《疆域圖》可見“深䉪”，為縣城南邊的海中沙洲。
清乾隆縣志記隸屬于附城“宣化坊”。
民國時期至1949年前屬第一區(qū)深環(huán)鄉(xiāng)。
1951年設深呂鄉(xiāng)。
1957年一度與九子沙合稱禮南鄉(xiāng)。
1958年稱深呂管理區(qū)。
1959年底改稱深呂大隊。
1967年改稱前進大隊。
1973年復稱深呂大隊。
1984年稱深呂鄉(xiāng)。
1986年稱深呂村委會。
1988年改稱深呂管理區(qū)。
1999年改稱深呂村委會，沿用至今。