1934年保甲制時，李店為上邽鎮(zhèn)43保中的第33保(糜李村）；1950年至1955年李店村為紅土鄉(xiāng)；1956年至1957年李店村為紅富鄉(xiāng)；1958年為城關(guān)鎮(zhèn)躍進(jìn)人民公社；1961年12月，從城關(guān)鎮(zhèn)人民公社劃出紅堡人民公社后，為李店大隊。
1983年為紅堡鄉(xiāng)李店村民委員會；2004年1月為紅堡鎮(zhèn)李店村民委員會。
2004年12月，北坡村撤銷，并入李店村。
2007年李店從山上易地搬遷在山下居住。
民國時期為保甲制，1949年初為李店村人民代表大會，1955年至1958年為李店農(nóng)業(yè)合作社，1958年至1980年為李店生產(chǎn)大隊，1983年至今為李店村村民委員會。