據(jù)上輩老人口述：頂坑村在明末崇禎期間，因戰(zhàn)亂引發(fā)社會動蕩而從漳浦縣移居于此；1949年解放后屬莆田縣第八區(qū)管轄（稱黨坑鄉(xiāng)），1949年解放后屬8區(qū)渡里鄉(xiāng)，1952年屬15區(qū)，1954年屬14區(qū)，1955年屬黨城鄉(xiāng)，1957年屬黨渡鄉(xiāng)頂坑村，1958年屬常太公社頂坑大隊(duì)，1961年屬渡山公社頂坑大隊(duì)，1965年屬常太公社頂坑大隊(duì)，1984年12月改為常太鄉(xiāng)頂坑村委會。
1992年月10月屬莆田縣常太鎮(zhèn)。
2002年為莆田市城廂區(qū)常太鎮(zhèn)頂坑村委會。